Jérôme Deschamps naît à Neuilly-sur-Seine. Deux oncles influents: le premier est acteur, Hubert Deschamps, le second cinéaste, Jacques Tati. Élève au Lycée Louis-le- Grand, il fréquente l’Atelier théâtral et rencontre Patrice Chéreau et Jean-Pierre Vincent, avant d’entrer à L’École de la Rue Blanche puis au Conservatoire National Supérieur d’Art Dramatique. Il entre pour trois ans à la Comédie Française. Antoine Vitez le mettra en scène à plusieurs reprises.

En 1978, il met en scène Blanche Alicata et La Famille Deschiens au Théâtre des Quartiers d’Ivry puis fonde avec Macha Makeïeff la compagnie de théâtre qu’ils dirigent ensemble. Ils créent plus de 20 spectacles en France et à l’étranger dans lesquels il joue : La Veillée, C’est Magnifique, Les Petits Pas, Lapin-Chasseur, Les Etourdis, Les Frères Zénith, et à l’opéra Les Brigands d’Offenbach direction de Louis Langrée et L’enlèvement au Sérail de Mozart direction de Marc Minkowski, puis Christophe Rousset. Avec Macha Makeïeff, ils réalisent le film d’animation La Véritable Histoire du Chat Botté.

En 2006, il met en scène et interprète Vingt-Six de Courteline, L’Affaire de la Rue de Lourcine de Labiche et La Méchante Vie d’après Henri Monnier.

Pour la télévision, il crée avec Macha Makeïeff la série-culte : les Deschiens. Au Centre National du Cinéma, il préside en 1996 et 1997 la Commission de l’Avance sur recettes dont il a initié la réforme.

En 2001, il fonde avec Sophie Tatischeff et Macha Makeïeff « Les Films de Mon Oncle », pour le rayonnement et la restauration de l’œuvre de Jacques Tati. La première restauration photochimique du film PlayTime est présentée lors du Festival de Cannes de 2002. Tout le long des travaux de restauration, différents spectacles de la Compagnie Deschamps & Makeïeff accompagnent certaines projections. En 2013 l’ensemble du catalogue de Jacques Tati est restauré sous son œil avisé.

De 2007 à 2015 il dirige l’Opéra Comique, auquel il redonne un rayonnement international et une identité fondée sur son répertoire historique. Il y crée l’académie de l’Opéra Comique.

Il met en scène Fra Diavolo d’Auber, direction musicale de Jérémie Rohrer, et en 2010 Les Boulingrin, création de Georges Aperghis d’après Georges Courteline.

En 2011, il met en scène à la Comédie-Française Un Fil à la patte de Georges Feydeau et reprend Les Brigands d’Offenbach à l’Opéra de Toulon et à l’Opéra Comique. Il interprète avec Michel Fau des lectures de Georges Courteline aux Bouffes du Nord en juin 2011 puis en tournée en France et à l’étranger. Il collabore à l’Opéra de Vienne pour la création Mahagonny Weill. En 2013 il met en scène un opéra d’Henri Rabaud, Mârouf, savetier du Caire, qui tournera en France jusqu’en 2018.

En 2016, il fonde la Compagnie Jérôme Deschamps, soutenue par le Ministère de la Culture et de la Communication, avec laquelle il produit Bouvard et Pécuchet et Le Bourgeois gentilhomme.